药学系依托青藏高原独特的地理环境、得天独厚的特色药物资源及民族药物优势，形成了以下研究团队：

1.高原特色药物研究团队

围绕我省特色药物资源及民族药物优势，采用现代医药学理论和技术，研究我省特色民族药物及其制剂在高原肺动脉高压、肺源性心脏病、缺血性心脏病、高原糖脂代谢紊乱等高原临床常见病、多发病方面的药理效应、作用机制以及物质基础。

2.药用植物资源保护与利用研究团队

调查研究青海省药用植物资源的分布、储量情况，资源特点、濒危物种等，研究物种的多样性、人工栽培技术和代用品的研究与开发，建立青海省药用植物数据库、资源多样性数据库、资源开发与应用数据库等，更好地合理开发、利用和保护药用植物资源。

3.高原低氧环境中药物代动力学研究团队

利用青藏高原独特的地理条件，将高原医学和药学相结合，研究高原环境下对药物代谢动力学的特征及机制。促进高原地区的临床安全用药研究和应用能力。