药学实验中心于2006年10月成立，在合理利用教学资源的理念指导下，以学科发展为主线，以提高实验教学资源利用率为目标，形成了实验教学涵盖多个关联学科和整个专业教育的总体思路，经过“青海省重点实验室建设项目”，“省部共建项目”“两级财政”的扶持，中心逐步建立起拥有先进的仪器设备、较高水平的实验项目和年龄结构合理、素质高、教学效果好的师资队伍以及良好的实验环境的药学实验中心，是青海省教育厅重点实验室。

    药学实验中心现有专兼职教师11人，其中，博士7人，副教授及副高级职称以上人员8人。中心由中药综合实验室、药物分析实验室、药物化学实验室、药剂学实验室、化学实验室、物理化学及分析化学实验室、中药标本室等11个教学实验室，以及中藏药研究中心、药学科研实验平台9个科研实验室组成。

    中心开设的实验课程有：中药学实验、中药方剂学实验、药用植物学实验、药物化学实验、药剂学实验、天然药物化学实验、药剂学实验，有机化学实验、分析化学实验、物理化学实验等20门实验课程。中心遵循先进的教学理念，逐步增加综合性、设计性、创新性试验数量，通过增加本科生实验教学相关仪器的购置，增设新的综合性实验，将知识性和实用性引入实验教学，激发学生学习兴趣，提高学生实践能力与教学效果。

    近五年来，依托药学科研平台及中藏药研究中心，共承担20余项国家级、省部级、厅级科研项目，科研经费达到600万。目前药学实验中心拥有教学仪器千余件，科研仪器设备百余件，设备总资产达1500万元。其中包括高效液相色谱仪、半制备液相色谱仪、气相色谱仪、固相萃取仪、紫外分光光度计、红外分光光度计等。实验室设施、环境、安全等设计科学合理，符合国家规范。